將父、母本按一定行比種植在隔離區(qū)內(nèi)，并將母本雄穗全部拔去，使其自由授粉，這種人工雜交方式，稱為隔離雜交。
選擇自交系
用來(lái)雜交的兩個(gè)自交系，應(yīng)該是經(jīng)過測(cè)交，證實(shí)其第一子代的雜種優(yōu)勢(shì)明顯，屬于優(yōu)良雜交組合。玉米自交系可向當(dāng)?shù)厣a(chǎn)部門購(gòu)買。
播種
父、母本在一塊地里按2行母本1行父本的行比相間種植，其四周至少500米以內(nèi)不種與父本不同的品種。形成隔離區(qū)。播種時(shí)應(yīng)將親本之一提前或延遲播種，以使父、母本花期相遇。這是隔離雜交法的成敗的關(guān)鍵。
母本去雄
在母本雄穗抽出期間，每天早晨沿母本行仔細(xì)檢查，發(fā)現(xiàn)有雄穗抽出時(shí)，立即拔除。拔除時(shí)應(yīng)握住雄穗向上拔，并注意不能損傷莖稈和頂葉。去雄一定要徹底。同時(shí)，如果父本行中發(fā)現(xiàn)有其它品種植株，也應(yīng)將其雄穗拔去。全部去雄時(shí)間，前后約需10～15天。每次拔下的雄穗，一定要帶出隔離區(qū)以外，以防止花粉飛散而發(fā)生混雜。
授粉
去雄以后，任其父、母本之間進(jìn)行自由授粉。為了提高結(jié)實(shí)率，可同時(shí)進(jìn)行人工輔助授粉。特別在父、母本花期不協(xié)調(diào)，或因氣候反常而造成花粉不足時(shí)，進(jìn)行人工輔助授粉，增產(chǎn)效果就更為顯著。關(guān)于父本果穗，要在母本果穗收獲后再進(jìn)行收獲，以防二者混雜。