隨著集裝箱運輸?shù)闹鸩桨l(fā)展、成熟，與之相適應(yīng)的，有別于傳統(tǒng)運輸方式的管理方法和工作機構(gòu)也相應(yīng)地發(fā)展起來，形成一套適應(yīng)集裝箱運輸特點的運輸體系。
主要包括：
1．經(jīng)營集裝箱貨物運輸?shù)膶嶋H承運人。包括經(jīng)營集裝箱運輸?shù)拇尽⒙?lián)營公司、公路集裝箱運輸公司、航空集裝箱運輸公司等等。
2．無船承運人。在集裝箱運輸中。經(jīng)營集裝箱貨運的攬貨、裝箱、拆箱、內(nèi)陸運輸及經(jīng)營中轉(zhuǎn)站或內(nèi)陸站業(yè)務(wù)，但不掌握運載工具的專業(yè)機構(gòu)，稱為無船承運人。它在承運人與托運人之間起著中間橋梁作用。
3．集裝箱租賃公司。這是隨集裝箱運輸發(fā)展而興起的一種新興行業(yè)。它專門經(jīng)營集裝箱的出租業(yè)務(wù)。
4．聯(lián)運保賠協(xié)會。一種由船公司互保的保險組織，對集裝箱運輸中可能遭受的一切損害進(jìn)行全面統(tǒng)一的保險。這是集裝箱運輸發(fā)展后所產(chǎn)生的新的保險組織。
5．集裝箱碼頭（堆場）經(jīng)營人。是具體辦理集裝箱在碼頭的裝卸、交接、保管的部門，它受托運人或其代理人以及承運人或其代理人的委托提供各種集裝箱運輸服務(wù)。
6．集裝箱貨運站（Container Freight Station，CFS）。在內(nèi)陸交通比較便利的大中城市設(shè)立的提供集裝箱交接、中轉(zhuǎn)、或其它運輸服務(wù)的專門場所。
7．貨主。