限制性核酸內切酶 識別DNA特定序列，切斷DNA鏈

DNA聚合酶Ⅰ 或其大片段（Klenow）①缺口平移制作標記DNA探針 ②合成cDNA的第二鏈③填補雙鏈DNA3’凹端④DNA序列分析
耐熱DNA聚合酶（Taq DNA聚合酶等） 聚合酶鏈反應（PCR）

DNA連接酶 連接兩個DNA分子或片段

多核苷酸激酶 催化多核苷酸5’羥基末端磷酸化，制備末端標記探針

末端轉移酶 在3’末端加入同質多聚物尾

SI核酸酶，綠豆核酸酶 降解單鏈DNA或RNA，使雙鏈DNA突出端變?yōu)槠蕉?/p>

DNA端酶Ⅰ 降解DNA，在雙鏈DNA上產生隨機切口

RNA酶A 降解除RNA

磷酸酶 切除核酸末端磷酸基

核酸酶
核酸外切酶（exonuclease）：是從核酸的一端開始，一個接一個把核苷酸水解下來；
核酸內切酶(endonuclease)：是從核酸鏈中間水解3’，5’磷酸二酯鍵，將核酸鏈切斷。

DNA限制性內切酶 粘性末端配對重組

同裂酶 有一些來源不同的限制酶識別的是同樣的核苷酸靶子序列，這類酶稱為同裂酶。同裂酶產生同樣的切割，形成同樣的末端。

同尾酶 這一類的限制酶來源各異，識別的靶字序列也不相同，但產生相同的粘性末端。由同尾酶產生的DNA片段，是能夠通過其粘性末端之間的互補作用彼此連接起來的。