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        siRNA制備方法比較

        放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-06

        比較項(xiàng)目

        化學(xué)合成

        體外轉(zhuǎn)錄

        RNase III降解dsRNA

        siRNA
        表達(dá)載體

        PCR
        表達(dá)框

        材料需求

        21-mer RNA
        oligos(
        一對(duì))

        29-mer DNA oligos(一對(duì))

        轉(zhuǎn)錄模版 (200-1000bp,兩側(cè)帶T7 啟動(dòng)子)

        55-60-mer DNA oligos(一對(duì))

        ~50-mer DNA oligos(一對(duì))

        全部制備/合成時(shí)間所需時(shí)間

        4—2

        24 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間

        1 轉(zhuǎn)錄模版制備時(shí)間

        5天以上 DNA oligo合成時(shí)間

        ~ 6 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間

        個(gè)人所需操作時(shí)間

        幾乎不需要*

        中等

        中等

        中等

        是否需要驗(yàn)證和尋找最有效siRNA

        需要

        需要

        不需要

        需要

        需要

        能否標(biāo)記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進(jìn)入細(xì)胞過(guò)程或者在細(xì)胞中的定位)

        不能

        不能

        轉(zhuǎn)染的相對(duì)難易程度

        可篩選性 (例如抗生素篩選)

        不可以

        不可以

        不可以

        可以

        不可以

        能否用于長(zhǎng)效抑制

        不可以

        不可以

        不可以

        可以(抗生素篩選)

        不可以

        能否大規(guī)模制備

        可以

        有限

        有限

        可以

        有限

        檢測(cè)總體轉(zhuǎn)染效率

        不可以

        不可以

        不可以

        可以

        不可以

        每個(gè)基因的相對(duì)費(fèi)用(不包含人力)

        中等

        中等

        中等

        *取決于合成后是否包含純化、去保護(hù),以及廠家提供的是已經(jīng)退火的即用型雙鏈還是凍干的單鏈

         

         

         
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